Zarówno aplikacja FishDeeper, jak i Deeper Smart Sonar są w pełni kompatybilne z dowolnymi urządzeniami Deeper. Zalecamy korzystanie z aplikacji FishDeeper, ponieważ zawiera ona wiele ulepszeń w zakresie łączności i użyteczności oraz będzie działać znacznie lepiej z echosondą.
Aplikacje FishDeeper i Deeper Smart Sonar mogą być zainstalowane w tym samym czasie na jednym smartfonie i mogą być używane zamiennie. Wszystkie dane zostaną zsynchronizowane między aplikacjami - wystarczy przejść do sekcji "Historia" używanej aplikacji i kliknąć przycisk chmury, aby rozpocząć synchronizację.