Autopilot und Sonar werden von der Fish Deeper Mobile-App gesteuert. Die auf der Karte innerhalb der App maximal zu speichernden interessanten Orte sind nicht begrenzt. Du kannst dem Autopilot des Deeper Quest die Anweisung geben, zu jedem beliebigen dieser Orte zu navigieren.
Oder du wählst einen rechteckigen bzw. quadratischen Bereich auf der Karte, der dann vom Deeper Quest über das Sonar automatisch gescannt und daraus eine Tiefenkarte generiert wird
Darüber hinaus kannst du auf der Karte einen Punktepfad erstellen, dem der Deeper Quest folgen soll. Die maximal zulässige Anzahl an Punkten in diesem Fall beträgt 999 (sprich, es gibt praktisch kein Limit).